Sono operative le 12 Direzioni regionali di BPER Banca, parte del nuovo modello organizzativo dopo la fusione per incorporazione di Unipol Banca. L'evoluzione da 10 a 12 Direzioni punta a consolidare il radicamento territoriale e a migliorare qualità ed efficacia dei servizi: le 958 filiali della Banca si trovano in 19 regioni.
Le nuove Direzioni regionali rispondono a due coordinatori per il Nord e per il Centro-Sud, rispettivamente Tarcisio Fornaciari e Gian Paolo Berardi, e sono così articolate: Direzione regionale Lombardia con sede a Milano (responsabile Diego Malerba), Direzione regionale Triveneto con sede a Verona (responsabile Giancarlo Guazzini), Direzione regionale Emilia ovest con sede a Reggio Emilia (responsabile Marco Bonezzi), Direzione regionale Emilia centro con sede a Modena (responsabile Ermanno Ruozzi), Direzione regionale Emilia est con sede a Bologna (responsabile Paolo Barchi), Direzione regionale Romagna-Marche con sede a Ravenna (responsabile Giuliano Lugli), Direzione regionale Toscana-Umbria con sede a Firenze (responsabile Massimo Biancardi), Direzione regionale Lazio con sede a Roma (responsabile Angelo Amodeo), Direzione regionale Abruzzo-Molise con sede a Lanciano (responsabile Giuseppe Marco Litta), Direzione regionale Campania con sede ad Avellino (responsabile Guido Serafini), Direzione regionale Puglia-Basilicata con sede a Matera (responsabile Salvatore Pulignano), Direzione regionale Calabria-Sicilia con sede a Crotone (responsabile Luigi Zanti).
È stato inoltre ampliato a 34 il numero di area manager che coordinano gli sportelli nei territori di riferimento.